En la línea de Genética y genómica de organismos marinos se estudian peces y moluscos,  centrándose en los aspectos que se relacionan a continuación:

• Trazabilidad de alimentos
• Elaboración de cariotipos
• Caracterización de stocks de reproductores en acuicultura
• Identificación de especies
• Determinación de variabilidad genética poblacional
• Detección de daño genético en bancos de esperma y debidos a contaminantes
• Mapeo físico de genes
• Elaboración de mapas genéticos integrados
• Evolución cromosómica
• Conservación de recursos genéticos
• Expresión génica

Este trabajo implica la utilización de técnicas moleculares como la clonación y secuenciación de genes (Sanger y NGS), así como otras de microscopía óptica, de fluorescencia y confocal. Se realizan técnicas de citogenética molecular (FISH) y transcriptómica. Se ha trabajado con diversas especies de peces y moluscos aunque los principales resultados y dedicación en este momento es al estudio del lenguado (Solea senegalensis) y de la ostra (Crassostrea angulata) .