El objetivo general de esta linea de investigación es determinar de un modo integral el papel de los organismos bentónicos en los flujos de materia y energía en medios marinos costeros, con enfasis en los medios someros como el saco interno de la Bahía de Cádiz.   

Aspectos que se estudian:

• Ecología del microbentos.
• Ecofisiología de productores primarios acuáticos (macroalgas y fanerógamas acuáticas).
• Modelos de crecimiento de fanerógamas.
• Modelos de procesos ecofisiológicos de organismos bentónicos.